Magistrantūros studijų programa Gamybos inžinerija skirta gilintis į inžinerines žinias apie šiuolaikinę gamybą, automatizuotos gamybos valdymo sistemas, naujausias kompozicines medžiagas ir jų gamybos technologijas. Tokie studijų dalykai, kaip gamybos valdymas, personalo valdymo metodologija, įmonės resursų planavimo sistemos, praplečia inžinerinės veiklos supratimą, išmokstama įvertinti gamybos įmonės veiklos visumą. Studijos remiasi moksliniais tyrimais, atliekami eksperimentai, išmokstama skaitinio modeliavimo.
Turima KU laboratorinė bazė leidžia atlikti įvairiausius šiuolaikinius tyrimus, kurti ir tirti įrangą, procesus, naujas medžiagas, atsižvelgiant į poveikį aplinkai. Studijų programoje numatytas mokslinis tiriamasis darbas, kuris tęsiamas visų studijų metu. Didelis dėmesys skiriamas švarioms technologijoms, darniai energetikai, tvariam išteklių panaudojimui be kurių jau neįsivaizduojama šiuolaikinė gamyba. Studentai turi galimybę atlikti mokslinę praktiką Klaipėdos miesto ar regiono įmonėse arba išvykti į užsienį.
Absolventai sėkmingai dirba gamybos inžinieriais, projektų vadovais, ekspertais. Gali rinktis mokslininko karjerą, darbą šiuolaikinėse laboratorijose, tyrimų institutuose ar mokslo įstaigose.
Yra galimybė tęsti studijas doktorantūroje.